三疣梭子蟹生长相关SNP位点的鉴定
2015-05-15分类号：S917.4
【部门】中国水产科学研究院黄海水产研究所 上海海洋大学水产与生命学院
【摘要】为了发掘三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)与生长相关的SNP,本研究基于三疣梭子蟹比较转录组学数据,筛选出生长相关候选基因片段19条,利用该基因序列设计引物进行PCR扩增,得到总长为17 387 bp的DNA片段;通过直接测序法发现74个SNP位点,分布频率为0.43/100 bp,其中转换突变的比例为80%,颠换突变的比例为20%,转换的比例远远大于颠换,符合"transition bias"原理。C/T(G/A)突变所占比例为60%,G/T(C/A)突变占20%,A/T突变占9.33%,G/C突变占10.67%,C/T(G/A)突变所占比例最大。内含子上突变发生...
【关键词】三疣梭子蟹 生长性状 转录组 SNP 关联分析
【基金】国家863计划项目(2012AA10A409); 农业科技成果转化资金项目(2013GB23260589); 山东省自主创新专项(2013CX80202); 国家自然科学基金项目(41306177); 中国博士后科学基金特别资助项目(2014T70668)
【所属期刊栏目】中国水产科学
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