湖鲚体内与生长环境菌群PCR-DGGE指纹图谱及多样性分析
2015-01-15分类号：S917.4
【部门】中国水产科学研究院淡水渔业研究中心 农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室 中国水产科学研究院东海水产研究所 农业部海洋与河口渔业资源及生态重点开放实验室 南京农业大学渔业学院 江阴市周庄镇农服中心
【摘要】利用PCR-DGGE技术,选择细菌原核通用引物F357-GC和R518对太湖湖鲚(Coilia ectenes taihuensis)鳃、肠壁及肠内容物及其生长环境菌群结构进行了初步分析。结果显示:PCR-DGGE指纹图谱分离显示49条清晰条带,样品菌群丰富度(DGGE条带数):湖水(33)>肠道壁(23)>湖泥(18)>肠道内容物(16)=鳃(16);相应的香农多样性指数分别为:3.11、2.76、2.21、2.37、2.30。湖鲚肠道壁、肠道内容物和鳃与湖水分别具有14、14、10条共有带,切胶回收测定其中21条优势条带,主要包含:变形菌(Proteobacteria)、放线菌(Actin...
【关键词】湖鲚(Coilia ectenes taihuensis) PCR-DGGE 细菌群落 香农多样性指数
【基金】中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(2013JBFT04); 农业部东海与远洋渔业资源开发利用重点实验室开放课题; 国家科技支撑计划项目(2012BAD26B05); 公益性行业科研专项(201203065)
【所属期刊栏目】淡水渔业
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