毛竹微型颠倒重复序列转座子PhTourist1的克隆与分析
2015-05-15分类号：S795.7
【部门】浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室培育基地
【摘要】【目的】微型颠倒重复序列(MITE)是DNA转座子中一类依赖自主转座子提供的转座酶进行转座的非自主转座子。以毛竹中与水稻m Ping同源的MITE——Ph Tourist1为例,研究Ph Tourist1的结构特点和转座特性,并分析Ph Tourist1的转座对其附近基因表达的影响,进而了解转座子对毛竹基因组多态性形成和基因表达调控的作用。【方法】利用MEGA5.1,DNAStar,Web Logo 3-Create等软件对Ph Tourist1的末端反向重复序列(TIR)、靶位点重复序列(TSD)、插入位点序列偏好性等进行系统的研究和分析,并计算Ph Tourist1在毛竹基因组中的插入时间...
【关键词】毛竹 Tourist-MITE mPing 转座 基因表达
【基金】国家自然科学基金项目“毛竹活性MITE的分离及与宿主基因表达调控网络互作机制解析”(31270645);国家自然科学基金项目“毛竹LTR反转录转座子转座调控机理及对宿主生物多样性的影响”(31470615); 浙江自然科学基金杰出青年项目“竹亚科LTR反转录座子的分布;增殖模式及对宿主基因组进化影响”(LR12C16001);浙江自然科学基金项目“Mariner-like转座酶的人工定向进化”(Y3100239); 浙江省重大科技专项“雷竹等中小径散生笋用竹新品种选育及推广”(2012C12908-2)
【所属期刊栏目】林业科学
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