杨树全基因组微卫星序列的统计及其生物信息学分析
2015-04-28分类号：S792.11
【部门】重庆三峡学院环境与化学工程学院 重庆三峡学院生命科学与工程学院
【摘要】本文利用生物信息学方法搜索毛果杨全基因组中完整型SSRs序列,并对其进行生物信息学分析。结果表明,毛果杨全基因组共统计了143 810个SSRs序列,占其全基因组长度的比率为0.63%,其全基因组SSRs序列出现频率为331.26个/Mb。毛果杨基因组中SSRs数量最多的是第1条染色体,其次是第2、5、6条染色体,数量较少的是第9条染色体。毛果杨各条染色体上SSRs序列出现频率在310~360个/Mb,无明显差异。通过检验表明,毛果杨染色体长度与其所含SSRs频率和密度无相关性(Kendall's tau-b,P>0.05;Spearman's rho,P>0.05),而其染色体长度与其所含S...
【关键词】杨树 全基因组 微卫星标记 生物信息学
【基金】重庆三峡学院人才引进项目(12RC03); 重庆三峡学院科研创新团队(201302); 重庆三峡学院青年项目(13QN12)
【所属期刊栏目】西南农业学报
文献传递
