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红松转录组SSR分析及EST-SSR标记开发

2015-08-15分类号:S791.247

【作者】张振  张含国  莫迟  张磊  
【部门】东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室  中国林业科学研究院亚热带林业研究所  
【摘要】【目的】红松已开发的分子标记缺乏共显性的遗传标记,尚不能满足分子标记辅助育种的需要。利用转录组数据开发SSR标记目前仍然是较为经济高效的DNA分子标记开发策略,本研究利用高通量测序技术开发红松EST-SSR标记,掌握其在转录组序列中的分布类型及特征,为红松的SSR多样性分析及变异分析提供基础。【方法】利用SSR检索程序从红松转录组41 476条Unigenes中筛选得到1 757个SSR位点,并对SSR位点的数量、分布特征进行统计分析。设计合成101对SSR引物,采用琼脂糖电泳初步检查和聚丙烯酰胺凝胶电泳分离检测方法确定引物的多态性,并收集扩增产物,送测序验证,最终开发出16对SSR引物。合成...
【关键词】红松  转录组  EST-SSR  遗传多样性
【基金】林业公益性行业科研专项“红松果材兼用林良种选育与定向培育技术研究”(201204320)
【所属期刊栏目】林业科学
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