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粗毛纤孔菌糖苷水解酶5基因克隆及蛋白质结构分析

2015-02-15分类号:S718.81

【作者】刘晓晗  王峰  董爱荣  陈俏丽  刘立宏  零雅茗  王博文  丁晓霞  王世新  
【部门】东北林业大学林学院  
【摘要】【目的】克隆得到粗毛纤孔菌糖苷水解酶5基因,并对该基因进行生物信息学分析、蛋白质原核表达和酶活研究,为糖苷水解酶的利用提供依据。【方法】分离纯化粗毛纤孔菌,并于PDA斜面长期保存。应用TRIzol提取粗毛纤孔菌总RNA,通过AMV反转录系统将RNA反转录成c DNA,构建c DNA文库;应用NCBI BLAST分析并检测糖苷水解酶基因家族5阳性序列,RACE法克隆基因全长命名为Ih GH5-1并提交NCBI注册;ORF-Finder分析Ih GH5-1基因开放阅读框,推导出氨基酸序列;筛选NCBI登录的糖苷水解酶家族5同源序列,Clustal W进行保守结构域区段多序列比对;应用Mega 5....
【关键词】粗毛纤孔菌  糖苷水解酶家族5  水曲柳  木材白色腐朽
【基金】林业公益性行业科研专项项目(201004079); 中央高校基本科研业务费专项资金项目(DL13BA01)
【所属期刊栏目】林业科学
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