苹果CAX基因家族生物信息学和表达分析
2014-11-21分类号:S661.1
【部门】南京农业大学果树生物技术实验室/园艺学院
【摘要】[目的]CAX(Ca2+/H+exchanger antiporter)是一类重要的跨膜转运蛋白,在植物体内阳离子转运上起着非常重要的作用。本文对苹果MdCAXs基因进行了生物信息学和组织特异性表达分析,以期为该类基因的功能研究奠定基础。[方法]利用生物信息学的方法对苹果MdCAXs基因家族染色体定位、蛋白质等电点、亲疏水性、跨膜区域、亚细胞定位及保守结构域进行了预测和分析,同时还分析了MdCAXs基因与其他物种CAXs基因的进化关系。采用实时荧光定量PCR法对苹果MdCAXs基因在不同盐处理下根、茎、叶中的表达变化进行分析。[结果]苹果MdCAXs家族包含8个成员,分别属于CAXsⅠ型中的A...
【关键词】苹果 MdCAXs基因家族 序列分析 生物信息学 表达分析
【基金】国家自然科学基金项目(31171935); 江苏省自然科学基金项目(BK2011639); 中央高校基本科研业务费专项资金(KYZ201310)
【所属期刊栏目】南京农业大学学报
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