应用克隆文库构建法研究番茄根系AMF多样性
2015-02-28分类号:S641.2
【部门】昆明学院/云南省高等学校都市型现代农业工程研究中心 云南大学医学院
【摘要】从昆明学院种植基地随机采取番茄根系样品,CTAB法提取DNA,运用巢式PCR扩增目的片段,获得产物连接转化入大肠杆菌JM109构建AMF 18S rRNA部分基因克隆文库,随机挑选50个克隆子,从中排除6个假阳性,经ARDRA分析产生了13个差异图谱,测序分析最终确定11个AMF序列。结果表明:文库的Coverage C值高达95.2%,且Rarefaction曲线亦趋于饱和;11个序列与免培养的Glomus属克隆序列相似度较高,代表了本属的不同AMF种类;其中seq1和seq9所代表的地表球囊霉Glomus versiforme和摩西球囊霉Glomus mosseae是侵染番茄根系的优势AM...
【关键词】AMF 18S rDNA Nested-PCR 系统发育分析
【基金】云南省应用基础研究自筹经费项目(2013FZ099); 昆明学院人才引进项目(YJL12002); 云南省高校都市型现代农业工程研究中心科研项目(DS-C201402)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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