池塘和工厂化养殖牙鲆肠道菌群结构的比较分析
2015-02-15分类号:S965.399
【部门】中国水产科学研究院黄海水产研究所 农业部海洋渔业可持续发展重点实验室 上海海洋大学水产与生命学院 日照市水利养殖场
【摘要】为研究池塘和工厂化养殖条件下牙鲆肠道菌群结构差异及其与饵料、水环境及底质等的关系,采用Mi Seq高通量测序技术和生物信息学分析手段,构建牙鲆肠道、养殖水体、饵料和池塘底泥等7个样品的16S rRNA基因测序文库,分析不同样品中的菌群组成和生物多样性。结果表明:池塘养殖牙鲆肠道(B1)中以厚壁菌门(30.49%)、变形菌门(19.16%)和梭杆菌门(11.11%)为主,其中芽孢杆菌属(27.66%)占绝对优势,弧菌属(0.16%)丰度最小;工厂化养殖牙鲆肠道(B5)中以变形菌门(44.31%)、厚壁菌门(11.57%)和放线菌门(4.79%)为主,其中不动杆菌属(10.37%)丰度最大,弧菌属...
【关键词】牙鲆 肠道菌群结构 16S rRNA MiSeq高通量测序
【基金】国家鲆鲽类产业技术体系(CARS-50)
【所属期刊栏目】水产学报
文献传递