瘟病毒属3种病毒多聚蛋白酶基因同义密码子偏爱性分析
2014-12-12分类号:S852.659.6
【部门】石河子大学动物科技学院预防兽医学重点实验室
【摘要】【目的】分析黄病毒科瘟病毒属的猪瘟病毒(CSFV)、牛病毒性腹泻病毒(BVDV)和羊边界病毒(BDV)3种病毒多聚蛋白酶基因密码子的使用特点,初步探讨3种病毒多聚蛋白酶基因的进化及对不同宿主的适应策略。【方法】运用EMBOSS软件的CHIPS和CUSP程序及CodonW在线分子生物学软件,分析CSFV、BVDV和BDV的有效密码子数(ENc),碱基GC含量(Gcall),密码子第1、2、3位GC含量(GC1、GC2、GC3),相对同义密码子使用度(RSCU)及同义密码子第3位的GC含量(GC3s),并对3种病毒多聚蛋白酶基因的ENc进行绘图分析。【结果】CSFV、BVDV、BDV 3种病毒多聚...
【关键词】黄病毒科瘟病毒属 多聚蛋白酶基因 同义密码子 偏爱性
【基金】新疆生产建设兵团国际科技合作计划项目(2012BC006); 公益性行业(农业)科研专项子课题项目(201303037-5)
【所属期刊栏目】西北农林科技大学学报(自然科学版)
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