少孢节丛孢菌丝氨酸蛋白酶家族基因的克隆及生物信息学分析
2015-02-28分类号:S852.6
【部门】石河子大学动物科技学院 中国农业科学院兰州兽医研究所
【摘要】本研究在国内首次对少孢节丛孢菌新疆分离株(XJ-A1)丝氨酸蛋白酶家族相关基因P12、P186和P233进行了扩增、克隆及测序,对其编码蛋白信号肽、疏水性与亲水性、高级结构、功能域进行预测和分析。结果显示:3个不同的丝氨酸蛋白酶均含有信号肽和天冬氨酸(D)、组氨酸(H)和丝氨酸(S)3个活性位点,表明它们均属于胞外分泌性Subtilase家族;同时,都含有2个潜在的N末端糖基化位点及2个与底物结合的S1区。系统发生分析发现,P12、P186和P233与其他不同地域、不同种属的丝氨酸蛋白酶基因亲缘性较远。本研究为研发预防动物消化道线虫的生物防控奠定了前期基础。
【关键词】少孢节丛孢菌 丝氨酸蛋白酶 基因克隆 生物信息学
【基金】农业公益行业专项子课题(201303037-5); 国家自然科学基金(31260601); 兵团博士资金(2010JC09)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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