中国南方八省(自治区)水稻纹枯病菌群体遗传结构的SSR分析
2015-07-02分类号：S435.111.42
【部门】扬州大学农学院/江苏省作物遗传生理重点实验室/教育部植物功能基因组学重点实验室 中国水稻研究所/水稻生物学国家重点实验室
【摘要】【目的】明确中国南方水稻纹枯病菌不同地理群体的遗传结构,为研究该病害的流行规律提供信息。【方法】采用8个SSR荧光标记对收集自中国南方8省(自治区)的188个水稻纹枯病菌进行检测。利用POPGENE version 1.31软件计算各项遗传多样性参数,近交系数由FSTAT 2.9.3软件估算。基于马尔可夫链模型,采用GENEPOP 4.2软件以卡方检验估计Hardy-Weinberg平衡。应用Arlequin 3.1软件进行分子方差变异分析,并通过遗传分化系数计算基因流。基于Nei’s遗传距离,利用MEGA5.0软件构建UPGMA树状图。使用STRUCTURE 2.3.3软件的贝叶斯聚类法进行...
【关键词】水稻纹枯病菌 SSR标记 遗传多样性 遗传分化 基因流
【基金】国家科技支撑计划(2012BAD19B03); 国家转基因生物新品种培育科技重大专项(2014ZX08010005-004); 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(2012RG003-4,2014RG005-2)
【所属期刊栏目】中国农业科学
文献传递
