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甘南牦牛CYGB基因的克隆及生物信息学分析

2015-03-12分类号:S823.85

【作者】娄延岳  杜晓华  罗玉柱  刘霞  张磊  
【部门】甘肃农业大学生命科学技术学院  甘肃省草食动物生物技术重点实验室  甘肃农业大学动物医学院  河南农业职业学院 动物科学系  
【摘要】【目的】探讨甘南牦牛CYGB基因的分子结构特征及生理功能。【方法】提取甘南牦牛血样基因组DNA,以其为模板PCR分段扩增后拼接得到CYGB基因,测序后进行生物信息学分析。【结果】克隆出甘南牦牛CYGB基因,其长度为8 484bp,含有4个外显子和3个内含子,外显子长度分别为143,232,164和34bp,内含子长度分别为5 175,280和2 379bp,可编码190个氨基酸残基,氨基酸编码存在明显的密码子偏倚现象。与普通牛相比较,甘南牦牛CYGB基因存在73处核苷酸变异位点,其中2处发生在外显子2区域,氨基酸序列未发生改变;71处发生在内含子区域。甘南牦牛CYGB拥有"three-over...
【关键词】甘南牦牛  胞红蛋白  基因  生物信息学
【基金】甘肃省自然科学基金项目(1107RJZA148); 甘肃省教育厅研究生导师项目(1102-04); 甘肃省高等学校基本科研业务费资助项目(2013); 甘肃农业大学科技创新基金项目(GAU-CX1037,GAU-CX1038)
【所属期刊栏目】西北农林科技大学学报(自然科学版)
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