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基于RNA-seq的百萨偃麦草染色体特异分子标记开发与应用

2015-03-16分类号:S512.1

【作者】李晨旭  刘志涛  庄丽芳  亓增军  
【部门】南京农业大学农学院/作物遗传与种质创新国家重点实验室/江苏省现代作物生产协同创新中心  
【摘要】【目的】百萨偃麦草(Thinopyrum bessarabicum L?ve,2n=2x=14,JJ或EbEb)是小麦改良的重要亲缘物种,开发染色体特异分子标记对于加快其有利基因向小麦中的转移和应用有重要意义。【方法】利用百萨偃麦草分蘖期叶片RNA-seq获得的EST序列与节节麦D基因组序列进行比对,鉴定出4 957条没有相似性的序列作为筛选百萨偃麦草特异序列的基础序列。从这些基础序列中随机选择部分序列设计EST-PCR引物507对,通过在普通小麦中国春、百萨偃麦草和中国春-百萨偃麦草双二倍体中的扩增分析,筛选出百萨偃麦草基因组特异标记,然后在已经选育出的8个小麦-百萨偃麦草异染色体系中进行染...
【关键词】百萨偃麦草  转录组  分子标记  易位系
【基金】国家自然科学基金(31170302); 高等学校创新引智计划(B08025); 江苏省高校优势学科建设工程资助项目
【所属期刊栏目】中国农业科学
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