西瓜果斑病菌T2SS分泌蛋白的筛选和功能预测
2015-04-02分类号:S436.5
【部门】华中农业大学植物科学技术学院 天津农学院图书馆
【摘要】利用KEGG和STRING数据库分析比较瓜类果斑病菌(西瓜嗜酸菌)(Acidovorax citrulli,Ac)和主要植物病原细菌Ⅱ型分泌系统(T2SS)的基因组成,收集有试验证据的植物病原细菌T2SS分泌蛋白序列信息,与已测序并经注释的果斑病菌AAC00-1菌株基因组进行序列比对,筛选出候选的果斑病菌同源T2SS分泌蛋白。通过对筛选出的分泌蛋白的信号肽、代谢通路、蛋白互作网络及其在植物细胞中的定位进行分析,预测部分分泌蛋白的生物学功能。
【关键词】细菌性果斑病 瓜类果斑病菌(西瓜嗜酸菌) 分泌蛋白 筛选 功能
【基金】国家公益性行业(农业)科研专项(201003066)
【所属期刊栏目】华中农业大学学报
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