【摘要】本文分析了现行高校专项拨款机制与高校科学发展和预算管理原则的矛盾性,揭示了项目设置、经费分配、资金结构、申报手续、预算执行等方面的问题,在借鉴英美日澳等国做法的基础上,从拨款体制、管理平台、资金结构、预算分配、高校自主权等方面提出了完善我国高校专项拨款机制的建议。