玉米大斑病菌MAPK基因St IME2的基因组定位、蛋白质结构预测及表达分析
2015-07-02分类号：S435.131.4
【部门】河北农业大学真菌毒素与植物分子病理学实验室 唐山师范学院生命科学系 伊利诺伊大学香槟分校食品科学与人类营养系
【摘要】【目的】确定玉米大斑病菌(Setosphaeria turcica)MAPK基因St IME2在基因组中的位置;系统解析目的蛋白质St Ime2的结构特征;分析玉米大斑病菌St IME2在不同发育时期及不同胁迫条件下(温度、氧胁迫、高渗胁迫)的表达,为深入研究该基因的功能奠定基础。【方法】通过本地Blast搜索玉米大斑病菌基因组数据库,确定St IME2在基因组的精确位置;利用Prot Param在线分析St Ime2蛋白的理化性质,利用SOMPA在线软件预测St Ime2蛋白的二级结构。通过PHYRE2在线服务器对St Ime2蛋白的三维结构进行预测。利用半定量RT-PCR方法分析不同发育时...
【关键词】玉米大斑病菌 St IME2 生物信息学分析 基因表达
【基金】国家自然科学基金(31171805,31271997,31371897); 河北省自然科学基金(C2012204033,C2013204061); 河北省高等学校科学技术研究项目(ZD20131009)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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