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水稻干尖线虫氨基肽酶基因克隆及功能初步分析

2015-08-28分类号:S435.111.48;Q78

【作者】王步勇  王峰  李丹蕾  马玲  陈俏丽  王博文  
【部门】东北林业大学林学院  
【摘要】为防治水稻干尖线虫病提供理论支持,研究了水稻干尖线虫氨基肽酶基因特征,并对其编码蛋白结构与功能进行分析。基于水稻干尖线虫转录组测序,并通过RACE技术,从水稻干尖线虫中克隆得到了一氨基肽酶基因AbAmpep。生物信息学进行基因分析,原位杂交实验进行表达定位分析。该基因CDS序列全长为2 787 bp,含有2个开放阅读框(ORF)。最长开放阅读框(ORF)大小2 661 bp,可编码886个氨基酸,蛋白分子量为101.74 k Da,理论等电点(PI)为5.78。编码蛋白氨基酸序列中具有2个Zn2+结合位点和1个Pep N保守结构域,有特征信号序列TISHELAHFW,属于谷氨酸锌蛋白(Glu ...
【关键词】水稻干尖线虫  氨基肽酶基因  基因克隆  生物信息学分析  原位杂交
【基金】高等学校博士学科点专项科研基金项目(20100062120002); 中央高校基本科研业务专项资金项目(2572015AA09)
【所属期刊栏目】华北农学报
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