水稻半纤维素支链合酶基因GT61家族的结构特征和组织表达分析
2015-02-15分类号:Q943.2
【部门】华中农业大学植物科学技术学院/作物遗传改良国家重点实验室/生物质与生物能源研究中心 华中农业大学生命科学技术学院
【摘要】从生物信息学和基因表达的角度,鉴定OsGT61家族成员的结构特征和组织表达特性。结果表明,OsGT61家族含有25个成员,分为3个亚类。A、B和C亚类分别含有19、3和3个成员,其基因的外显子数介于1~7个。其蛋白质大小为49.1~73.8ku,pI为5.4~10.4。该家族蛋白质的C端motif较为保守。而且,它们含有Ser/Thr激酶的磷酸化位点分别为9~29个和3~13个,Tyr激酶的磷酸化位点小于7个。但是,该家族成员的糖基化位点相对较少,16个成员存在1~4个O-糖基化位点,3个蛋白存在1~2个N-糖基化位点。基因表达芯片聚类分析和半定量RT-PCR检测表明,OsGT61基因家族主要...
【关键词】水稻 半纤维素 OsGT61基因家族 结构特征 基因表达
【基金】国家“973”计划项目(2010CB134401)
【所属期刊栏目】中国农业大学学报
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