吉富罗非鱼YY超雄鱼和XY雄鱼消减文库的构建及差异基因分析
2014-06-28分类号:S965.125
【部门】广西水产科学研究院 广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室
【摘要】以吉富罗非鱼YY超雄鱼和XY雄鱼的血液为试验材料,采用抑制性消减杂交技术(SSH)构建YY超雄罗非鱼和XY雄鱼的消减文库。采用PCR方法评价文库的质量后,通过DNA测序技术对204个克隆进行测序,经手动去除载体和引物序列后获得86条Contig,应用BLASTX和BioGPS程序对所获Contigs进行生物信息学分析。成功构建了吉富罗非鱼YY超雄鱼和XY雄鱼消减文库,文库库容量(CFU)为3860,库重组率为95%,所获得的DNA片段集中分布在400~650 bp之间。获得31条罗非鱼序列,19条非罗非鱼序列,36条序列未发现同源蛋白,可能为YY罗非鱼的新基因。对罗非鱼种属的25条差异序列进行...
【关键词】吉富罗非鱼 超雄鱼 消减文库 差异基因
【基金】广西自然科学基金项目(2011GXNSFB018034); 十二五国家罗非鱼产业技术体系南宁综合试验站建设项目(CARS-49)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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