亚东鲑基因组中Tc1-like转座子的序列歧化特征分析
2013-12-18分类号：S917.4
【部门】上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室
【摘要】根据鱼类Tc1-like超家族转座子的末端反向重复序列设计单引物,对西藏亚东鲑基因组进行PCR扩增、回收、克隆和测序,鉴定出亚东鲑两条长度为1 607 bp和1 473 bp的Tc1-like超家族转座子序列,命名为Tbt1和Tbt2。序列分析表明,亚东鲑Tbt1转座子左右两端分别存在一个196 nt和225 nt的末端反向重复序列(Inverted terminal repeats,ITR),在左右ITR中分别包含2个12 nt的亚末端反向重复序列(Subterminal inverted repeats,SIR);亚东鲑Tbt2转座子分别存在一个32 nt和31 nt短的ITR,其左右IT...
【关键词】亚东鲑 Tc1-like转座子 序列分析
【基金】农业公益性行业专项课题(201203086); 国家自然科学基金(31272633,31201760); 上海高校知识服务平台(ZF1206)
【所属期刊栏目】上海海洋大学学报
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