金鱼头瘤形成相关基因差减文库的构建与分析
2013-12-13分类号:S917.4
【部门】北京市水产技术推广站 华中农业大学水产学院 淡水水产健康养殖湖北省协同创新中心
【摘要】采用差减抑制杂交技术(SSH)以1龄红狮头金鱼(Carassius auratus)的头瘤组织为检测子(Tester),40日龄红狮头金鱼幼鱼的头顶上皮组织为驱动子(Driver),构建金鱼头瘤相关基因的差减cDNA文库。以鲫管家基因α-tubilin为参照检测差减效率,结果表明该文库差减效率达210倍,效率较高。随机挑选阳性克隆进行接头特异引物的PCR检测,结果表明插入片段均在0.1~2.0kb之间。利用斑点杂交对PCR检测结果为单一条带的阳性克隆进行筛选并测序,获得高差异性的有效序列93条。通过生物信息学方法对文库序列进行比对、分类和注释,发现若干结缔形成基因和原癌/抑癌基因等与金鱼头瘤形...
【关键词】金鱼 头瘤 差减抑制杂交 cDNA文库
【基金】现代农业产业技术体系北京市观赏鱼创新项目(pxm2012-036237-000139)
【所属期刊栏目】华中农业大学学报
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