鲂属鱼类线粒体基因组的比较及其系统发育分析
2014-01-15分类号:S917.4
【部门】华中农业大学水产学院 农业动物遗传育种与繁育教育部重点实验室 农业部淡水生物繁育重点实验室 信阳农林学院水产科学系
【摘要】基于GenBank中团头鲂线粒体基因组全序列和三角鲂、厚颌鲂、广东鲂的部分线粒体基因组序列,设计引物扩增出三角鲂、厚颌鲂和广东鲂3种鱼线粒体基因组全序列,同时对4种鲂属鱼类线粒体基因组全序列进行了比较分析。结果表明,4种鲂属鱼类线粒体基因组基因排列顺序完全相同,排列紧密,均包含13个蛋白质编码基因、22个tRNA、2个rRNA、1个非编码控制区(D-loop区)和1个轻链复制起始区(OL区)。除ND6和8个tRNA在L链上编码外,其余的基因均在H链上编码。4种鲂属线粒体基因组13个蛋白质编码基因中,均呈现出较强的A+T偏向性和C碱基偏好。全序列比对结果显示,共有758个变异位点,其中非简约性信...
【关键词】鲂属 线粒体基因组 变异位点 分子标记 系统发育
【基金】国家自然科学基金项目(31201988); 现代农业产业技术体系建设专项(CARS-46-05); 中央高校基本科研业务费专项(2011PY023,2011SC27,2011ZC011,2012YB08,2011QC030)
【所属期刊栏目】水产学报
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