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达氏鳇肌肉组织转录组测序和功能分析

2014-09-15分类号:S917.4

【作者】赵文  高峰英  石振广  
【部门】大连海洋大学辽宁省水生生物学重点实验室  云南阿穆尔鲟鱼集团有限公司  
【摘要】为发掘达氏鳇的功能基因,采用新一代高通量测序技术对达氏鳇肌肉组织转录组进行测序。结果获得原始数据14 447 211 200 bp,拼接获得了55 531条单基因序列(unigene),长度范围300~32 613 bp,平均长度941 bp。利用生物信息学方法对unigene进行了非冗余蛋白质数据库(Nr)相似搜索,此外还进行了GO的功能注释和KEGG代谢通路分析。结果一共有20 735条unigene(37.34%)与Nr数据库中的己知基因同源;根据GO功能可分为生物过程、细胞组分和分子功能3大类56分支;依据KEGG代谢通路分析可以分成290类。
【关键词】达氏鳇  肌肉组织  基因  转录组
【基金】横向联合项目“达氏鳇基础生物学研究”(2012-2014)
【所属期刊栏目】水产学报
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