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半滑舌鳎线粒体DNA含量测定方法的建立与优化

2014-09-15分类号:S917.4

【作者】冯文荣  柳淑芳  庄志猛  马骞  苏永全  唐启升  
【部门】厦门大学海洋与地球学院  山东省渔业资源与生态环境重点实验室  中国水产科学研究院黄海水产研究所  
【摘要】本研究旨在应用实时荧光定量PCR技术,建立半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)线粒体DNA(mtDNA)含量测定方法并进行优化。通过质粒标准品的线性化处理、模板DNA的酶切和超声处理、mtDNA和核DNA(nDNA)基因引物的筛选实验,建立半滑舌鳎mtDNA含量测定方法。结果表明,质粒标准品的构象对荧光定量PCR标准曲线影响较大,线性化的质粒更适合用作标准品;酚-氯仿方法提取的模板DNA适用于mtDNA含量测定,无需进行预处理;用D-loop和ND1这2对引物所得的拷贝数较小且结果一致,适用于mtDNA拷贝数的测定;以不同核基因为参照所得的mtDNA含量可能存在差异,当以单...
【关键词】线粒体DNA含量  实时荧光定量PCR  半滑舌鳎  优化
【基金】国家自然科学基金项目(31172411,31201981); 国家国际科技合作专项项目(2013DFA31410)
【所属期刊栏目】中国水产科学
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