家蚕sirtuin家族基因的鉴定及系统发生与表达芯片分析
2014-07-02分类号:S881.2
【部门】西南大学生物技术学院/家蚕基因组生物学国家重点实验室/农业部蚕桑功能基因组与生物技术重点实验室
【摘要】【目的】鉴于sirtuin家族基因重要而多样性的功能,从家蚕全基因组中鉴定sirtuin家族基因,并进行基因结构、蛋白结构及其理化性质、基因进化、组织表达芯片分析及在不同组织中的定量表达情况分析,为研究家蚕sirtuin家族基因的功能和推动家蚕模式生物系统化的研究奠定基础。【方法】基于家蚕基因组数据库,通过生物信息学手段,利用比较基因组学方法,鉴定家蚕sirtuin家族成员;开放阅读框(ORF)的预测用ORFfinder进行;使用SIM4进行ORF的内含子和外显子的预测;用GSDS和ExPaSy在线工具分别进行基因结构图和蛋白序列理化性质的预测;用CLUSTAL_X软件进行多序列联配及对其二级...
【关键词】sirtuin 生物信息学 表达特征 家蚕
【基金】国家“863”计划(2013AA102507); 国家自然科学基金(31372379); 中央高校基本科研业务费重大培育项目(XDJK2013A001)
【所属期刊栏目】中国农业科学
文献传递