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猪新基因KCNJ12编码区电子克隆、RT-PCR验证和组织表达分析

2014-02-28分类号:S828

【作者】秦彩艳  霍金龙  王配  王淑燕  苗永旺  潘伟荣  査星琴  曾养志  
【部门】云南农业大学云南省版纳微型猪近交系重点实验室  云南农业大学动物科学技术学院  
【摘要】通过NCBI下载猪近缘物种的KCNJ12基因序列,在线BLAST比对获得猪EST序列、参考基因组序列和高通量基因组序列。利用Lasergene软件电子克隆猪KCNJ12基因编码区序列及部分侧翼序列。针对编码区设计特异引物并以版纳微型猪近交系BMI为研究材料进行试验验证,同时应用半定量RT-PCR技术对BMI 31种重要组织进行了表达分析。研究获得了猪KCNJ12 1 290 bp的编码区序列(GenBank登录号:KC505155,对应的氨基酸登录号:AGK36093)。生物信息学分析表明,该基因编码429个氨基酸,预测的蛋白质分子量(Mw)为48.63 kDa,等电点(pI)为5.66。蛋白...
【关键词】内向整流型钾离子通道亚家族J成员12  电子克隆  版纳微型猪近交系  生物信息学  组织表达
【基金】国家自然科学基金项目(31160439); 云南农业大学学生科技创新创业行动基金项目
【所属期刊栏目】华北农学报
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