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天祝白牦牛APEX-1基因的克隆及生物信息学分析

2014-04-28分类号:S823

【作者】李亚兰  张全伟  王雪莹  马友记  张勇  赵兴绪  
【部门】甘肃农业大学动物医学院  甘肃农业大学动物科技学院  
【摘要】克隆天祝白牦牛脱嘌呤嘧啶核酸内切酶基因(APEX-1)全长cDNA序列,为研究天祝牦牛高原抗逆性机制提供理论基础。根据已知哺乳动物APEX-1基因cDNA序列同源性,设计引物以及5'和3'特异性引物,运用cDNA末端快速扩增(RACE)技术获得天祝白牦牛APEX-1基因全长cDNA序列。扩增获得天祝白牦牛APEX-1基因全长cDNA序列为1 391 bp(GenBank登录号:KF611690),ORF长957 bp,编码318个氨基酸。氨基酸序列分析显示天祝白牦牛APEX-1基因编码氨基酸序列与大多数哺乳动物相似,但有7个氨基酸突变。同源建模预测,显示天祝白牦牛APEX-1蛋白由8个α-螺旋...
【关键词】天祝白牦牛  脱嘌呤嘧啶核酸内切酶  cDNA末端快速扩增  序列分析
【基金】“十二五”农村领域国家科技计划项目(2013AA02505-3)
【所属期刊栏目】华北农学报
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