利用16S rRNA基因克隆文库技术分析德昌水牛瘤胃产甲烷菌的多样性
2014-08-25分类号：S823
【部门】中国农业科学院广西水牛研究所 农业部(广西)水牛遗传繁育重点实验室
【摘要】选取3头5岁左右的健康雌性德昌水牛作为试验动物,采用机械破壁法提取瘤胃内容物总DNA,用产甲烷菌特异性引物Met86F/Met1340R扩增16S rRNA基因,构建16S rRNA基因克隆文库,分析德昌水牛瘤胃产甲烷菌区系组成。结果表明:试验共获得99个16S rRNA基因序列,RDP分析表明94.2%的序列为甲烷短杆菌属(Methanobrevibacter)16S rRNA序列,按照97%的相似性划分为19个分类操作单元,其中96个序列(17个OTUs)占总序列的97.0%,与已知细菌的16S rRNA序列的相似性≥97%;3个序列(2个OTUs)占总序列的3.0%,与已知细菌16S r...
【关键词】德昌水牛 瘤胃 产甲烷菌 16S rRNA 多样性
【基金】广西自然科学基金青年基金项目(2012GXNSFBA053070); 广西水产畜牧兽医局科技计划项目(桂渔牧科1304516); 广西特聘专家岗位专项(2014GXTPZJ018); 农业部“948”项目(2011–G26)
【所属期刊栏目】湖南农业大学学报(自然科学版)
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