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油茶花发育转录组测序及相关基因表达分析

2014-09-15分类号:S794.4

【作者】胡玉玲  姚小华  任华东  王开良  林萍  
【部门】中国林业科学研究院亚热带林业研究所  
【摘要】通过对油茶成花过程的转录组测序及其成花相关基因的表达分析,结果表明:转录组测序总共获得28 448 847个reads,5 742 023 480 bp数据量,GC含量为46.52%;拼接成大于200 bp以上的Unigenes有94 476条,N50长度为806 bp,其中1 kbp以上的Unigenes共12 643条,占Unigene总数的13.38%;Unigenes在各数据库中功能注释数目,在COG中有9 095条,在GO中有27 201条,在KEGG中有6 431条,在Swissprot中有24 534条,在TrEMBL中有36 393条,在Nr中有36 400条,在Nt中有30 ...
【关键词】油茶  转录组  高通量测序  成花基因  成花途径
【基金】国家科技支撑项目“油茶高产优质新种质创制”(2009BADB1B01);油茶产业升级关键技术研究与示范(2009BADB1B00)
【所属期刊栏目】林业科学
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