欧洲黑杨PnEXPA1基因多态性与稳定碳同位素比率的关联分析
2014-06-15分类号：S792.119
【部门】林木遗传育种国家重点实验室 中国林业科学研究院林业研究所 国家林业局林木培育重点实验室
【摘要】对欧洲黑杨α-expansin基因PnEXPA1的SNP多态性与水分利用效率相关性状稳定碳同位素比率(δ13C)进行了关联分析。利用SNaPshot技术对PnEXPA1基因内11个SNP位点进行了基因型分型,发现各SNP位点优势基因型均为纯合,且其频率高于杂合基因型。关联分析显示:SNP8和SNP12在采用单因素方差分析(ANOVA)和一般线性模型(GLM)2种方法时均与δ13C值显著关联。SNP8为exon 1内的无义突变,可解释6.620%的表型变异;而SNP12位于intron 1中,遗传贡献率为6.613%;这2个SNP位点与SNP9、SNP13共同位于一个高连锁不平衡(LD)的单倍型...
【关键词】欧洲黑杨 伸展蛋白基因 单核苷酸多态性 稳定碳同位素比率 关联分析
【基金】国家自然科学基金项目(31000310); 国家“十一五”科技支撑项目(2006BAD01A15)
【所属期刊栏目】林业科学研究
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