早酥梨及其红色芽变Ty1-copia反转录转座子逆转录酶的克隆与分析
2014-04-25分类号:S661.2
【部门】西北农林科技大学园艺学院 农业部西北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室
【摘要】【目的】从早酥梨及其红色芽变基因组中克隆Ty1-copia反转录转座子逆转录酶序列,分析其特点和差异。【方法】根据Ty1-copia反转录转座子逆转录酶保守区域设计简并引物,建立并优化PCR扩增体系,回收、克隆、测序得到的目的基因序列。【结果】成功从早酥梨基因组和红色芽变材料中分别获得29,30条逆转录酶序列,序列大小均为260bp左右。生物信息学分析表明,与早酥梨相比,红色芽变的逆转录酶序列多发生终止子突变、缺失突变、替换突变。聚类分析可将所得序列分为7个家族,基于逆转录酶序列进行的不同物种进化树分析显示,第7家族序列与苹果和李具有很高的同源性,可能是反转录转座子横向传递的结果。【结论】早酥...
【关键词】梨 红色芽变 逆转录酶 进化分析
【基金】国家自然科学基金项目(31171925); 高校基本科研业务费项目(ZD2013005)
【所属期刊栏目】西北农林科技大学学报(自然科学版)
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