白菜硫代葡萄糖甙合成中MAM的进化分析
2014-10-30分类号:S634;Q943.2
【部门】中国农业科学院蔬菜花卉研究所/农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室
【摘要】【目的】探索硫代葡萄糖甙合成中关键基因-甲基硫代烷烃基苹果酸合成酶(methylthioalkylmalate,MAM)基因在白菜基因组中的进化情况,为研究白菜MAM的功能提供理论指导。【方法】根据白菜数据库BARD信息分析拟南芥、盐芥和白菜MAM的共线性关系,利用MEME在线软件预测MAM序列的高度保守基序(motif),通过R软件分析93份白菜材料MAM的表达模式,并利用MEGA5.05软件构建MAM的系统进化树。【结果】白菜的3个亚基因组均保留着MAM的同源基因。其中与拟南芥具有共线性的5个同源基因可能源自基因组古三倍化复制,其它两个同源基因可能是由转座扩增产生的;基序分析结果表明,与拟...
【关键词】白菜 硫甙 白菜MAM 共线性 进化树
【基金】国家“863”计划项目(2012AA100101); 国家“973”计划项目(2012CB113906)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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