甘蓝型油菜核心SSR引物筛选及指纹图谱构建
2015-01-15分类号:S565.4
【部门】四川省农业科学院作物研究所/农业部植物新品种测试(成都)分中心 四川农业大学农学院 农业部科技发展中心
【摘要】为筛选一组适合甘蓝型油菜DNA指纹鉴定的核心SSR引物,进而构建甘蓝型油菜品种的SSR指纹图谱库,本研究采用6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳技术和毛细管电泳技术,对952对甘蓝型油菜SSR引物进行筛选。采用入选的核心引物,以等位变异大小形式,构建184份甘蓝型油菜品种的指纹图谱,并对影响等位变异大小的因素进行分析。综合考虑引物多态性信息含量(PIC)、条带清晰度、重复性及染色体分布,确定47对核心引物。结果表明,47对引物检测到51个位点,平均每条染色体2.6个,PIC值介于0.2314~0.9253,平均为0.6004。等位变异大小影响因素分析结果表明,荧光基团(6-FAM、HEX、ROX和TAM...
【关键词】甘蓝型油菜 简单重复序列 核心引物 指纹图谱
【基金】公益性行业(农业)科技专项(200903008)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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