甘薯近缘种Ipomoea trifida (Kunth) G.Don基因组Fosmid文库构建及PCR筛选体系建立
2014-04-28分类号：Q943.2
【部门】中国农业科学院甘薯研究所 江苏徐州甘薯研究中心 农业部甘薯生物学与遗传育种重点实验室 河北省农林科学院经济作物研究所
【摘要】为挖掘有价值的基因资源,对甘薯近缘种I.trifida的基因组文库进行了研究。通过流式细胞法测定I.trifida(2x,编号DLP4597)基因组大小为531.699 Mb。以叶片为材料采用包埋法提取基因组DNA,通过物理剪切进行基因组DNA片段化并进行末端平滑化和磷酸化处理,脉冲场电泳回收33~48 kb的DNA片段,然后连接到Fosmid载体pCC1FOS(Epicentre)上,包装转化大肠杆菌EPI300,构建了I.trifida的基因组Fosmid文库,该文库包含101 952个单克隆,保存于1 062个96孔培养板中,平均插入片段35 kb,覆盖基因组约6.7倍,理论上任意片段筛...
【关键词】甘薯近缘野生种 基因组 Fosmid文库 文库筛选体系
【基金】国家自然科学基金项目(31371681;30800698); 国家甘薯产业技术体系(CARS 11-B-02); 农业部948项目(2011-G1-20); 国家“863”项目(2012AA101204-1-8)
【所属期刊栏目】华北农学报
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