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大豆基因组CLC同源基因家族的生物信息学分析

2014-03-29分类号:Q943.2

【作者】李伟  王龙超  曹金花  於丙军  
【部门】南京农业大学生命科学学院  
【摘要】利用NCBI网站、Phytozome数据库和有关生物信息学软件,对大豆基因组CLC(chloride channel)同源基因家族进行系统的预测分析和比较。结果表明:大豆CLC同源基因有8~9个拷贝,分别分布于第1、5、9、11、13、16和19号染色体上,内含子数目为4~23;编码的大豆CLC蛋白氨基酸数量为725~823,整体一致性为63.43%,相对分子质量为(80~91)×103,理论等电点为6.45~8.94,带正或负电荷氨基酸残基比例为7%~10%,均为跨膜蛋白(含9~12个跨膜区),除Glyma16g06190外均含有2个CBS结构域;具有(Ⅰ)GS/PGIPE、(Ⅱ)GKE/A...
【关键词】大豆  CLC同源基因  CBS结构域  氨基酸残基保守区  通道蛋白  转运蛋白
【基金】国家转基因生物新品种培育重大专项(2009ZX08004-008B); 国家自然科学基金项目(30871462)
【所属期刊栏目】南京农业大学学报
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