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京海黄鸡GnRHR基因克隆、生物信息学及组织表达分析

2014-10-28分类号:Q78

【作者】张涛  张跟喜  王金玉  樊庆灿  王文浩  韩昆鹏  王永娟  
【部门】扬州大学动物科学与技术学院  江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室  江苏京海集团  
【摘要】旨在根据GenBank上公布的原鸡GnRHR基因序列设计2对引物,采用RT-PCR方法,从京海黄鸡肌肉组织中克隆GnRHR基因的编码区序列,并使用多种生物软件和在线工具对目的序列进行生物信息学分析,分析GnRHR基因与其他物种的同源性、蛋白质的理化性质、蛋白质序列的跨膜区、亚细胞定位、亲水性、潜在的磷酸化位点、保守结构域及该基因编码蛋白的二级结构、三级结构等。同时为GnRHR基因和β-actin基因各设计1对引物,采用RT-qPCR的方法研究GnRHR基因在京海黄鸡12个组织和器官中的表达情况。最终成功克隆了京海黄鸡GnRHR基因完整的编码区序列和部分侧翼序列,Blast结果显示,京海黄鸡Gn...
【关键词】京海黄鸡  GnRHR  克隆  生物信息学分析  组织表达
【基金】江苏省高校自然科学研究项目(12KJB230003); 国家肉鸡产业技术体系项目(nycytx-42-G1-05); 江苏高校优势学科建设工程项目; 江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室项目
【所属期刊栏目】华北农学报
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