3种溞属动物线粒体COⅠ基因及其侧翼序列的PCR扩增与分析
2014-04-09分类号:Q78
【部门】淮北师范大学生命科学学院
【摘要】采用PCR产物直接测序法测定了3种中国常见溞属(Daphnia)动物的线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ亚基基因(COⅠ)及其侧翼序列。结果表明扩增出的线粒体DNA片段在碱基使用上存在明显偏倚,A+T含量均超过60%,且在重链上多使用T。推测3种中国溞属动物COⅠ基因的终止密码子均为不完整的终止密码子(T__),而隆线溞(D.carinata)及大型溞(D.magna)COⅠ基因的起始密码子可能是(A)CTA,较为少见。基于COⅠ基因DNA或氨基酸序列进行了同源性、进化分歧及密码子使用偏向性等方面的比较,分析结果和采用不同方法构建的分子系统进化树均显示:中国来源的两种溞属动物隆线溞与大型溞亲缘关系较近,显...
【关键词】溞属 线粒体DNA COⅠ基因 系统进化
【基金】国家自然科学基金项目(81272377,31370470); 安徽省自然科学基金项目(1208085MC45)
【所属期刊栏目】南京农业大学学报
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