类植物乳杆菌L-XM1 plnBCD基因的生物信息学分析
2014-06-15分类号:Q75
【部门】河北经贸大学生物科学与工程学院 中国农业大学食品科学与营养工程学院
【摘要】为了解类植物乳杆菌L-XM1 plnBCD编码蛋白的生物学特性,并推测其功能,综合运用RPS-Blast、InterProscan和TMHMM Server等多种生物信息学软件预测分析plnBCD编码蛋白的理化性质、疏水性、磷酸化位点、保守性功能域及二级结构,并用Swiss-model同源建模。结果表明:plnB编码蛋白为疏水性蛋白,定位于细胞质膜上,有6个跨膜区、21个磷酸化位点和1个HATPase_c结构域,具有大多数组氨酸蛋白激酶的基本性质。其二级结构以α-螺旋和延伸链为主要构件,其空间结构与组氨酸蛋白激酶的结构特征一致。plnC及plnD编码蛋白均为亲水性蛋白,不具有跨膜区,定位于细胞...
【关键词】类植物乳杆菌 生物信息学分析 同源建模 群体感应系统
【基金】国家自然科学基金资助项目(31071591)
【所属期刊栏目】中国农业大学学报
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