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猪沙波病毒CH430株p70基因克隆与生物信息学分析

2014-06-28分类号:S852.651

【作者】刘伟  王恩丽  柳纪省  杨彬  兰喜  
【部门】中国农业科学院兰州兽医研究所  家畜疫病病原生物学国家重点实验室  草食动物疫病重点开放实验室  甘肃农业大学动物医学院  
【摘要】利用RT-PCR方法从猪沙波病毒CH430株中克隆出非结构蛋白p70基因并测序,结果显示,p70基因全长1 995 nt,编码665个氨基酸,经同源性比对及遗传进化树分析表明,CH430株为基因Ⅲ型沙波病毒毒株。生物信息学分析显示该蛋白理论等电点(pI)为5.96,理论分子质量为72 876.6 u;其序列上共发现25个磷酸化位点,分别为Ser(6)、Thr(13)、Tyr(6),而蛋白的磷酸化与信号传导有关,预测该蛋白为一重要的信号传导分子;无信号肽和跨膜区;该蛋白含有胰蛋白酶样丝氨酸蛋白酶和RdRp功能域;胰蛋白酶样丝氨酸蛋白酶功能域核心结构为1个由7个β折叠形成柱状结构和1个由1个α螺旋...
【关键词】猪沙波病毒  非结构蛋白p70  克隆  生物信息学分析
【基金】
【所属期刊栏目】华北农学报
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