热应激奶牛血清miRNA表达谱及miR-181a靶基因分析
2014-11-30分类号：S823
【部门】南京农业大学动物科技学院
【摘要】通过分析热应激奶牛和正常奶牛血清差异表达miRNA,及对重要的候选miRNA进行靶基因预测及相关生物信息学分析,探索miRNA在荷斯坦奶牛发生热应激过程中的作用及其调控机制。利用miRNA高通量测序技术对奶牛血清中miRNA表达谱进行检测和分析以筛选差异表达miRNA;用RT-qPCR方法验证4个在热应激奶牛血清与正常奶牛血清中显著差异表达的候选miRNAs;采用Targetscan生物信息学计算方法预测目标miR-181a(对应激以及免疫反应可能起重要调节作用)的靶基因,并对靶基因进行GO注释描述、富集分析及KEGG富集。结果表明:miRNA高通量测序分析发现共有52个差异表达极显著miRN...
【关键词】荷斯坦奶牛 热应激 miRNAs 靶基因 信号通路
【基金】江苏省科技计划自然科学基金项目(SBK201241530); “十二五”国家科技支撑计划项目(2011BAD28B02,2012BAD12B00); 中央高校基本科研业务费专项资金(KYZ201413); 江苏省博士后科研资助计划项目(1302002B)
【所属期刊栏目】南京农业大学学报
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