油桐烯脂酰CoA还原酶的克隆与表达模式分析
2014-11-15分类号:S794.3
【部门】中南林业科技大学经济林培育与保护省部共建教育部重点实验室
【摘要】以葡萄桐近成熟种子为材料,根据油桐转录组数据库中已知部分烯脂酰CoA还原酶(enoyl-CoA reductase,ECR)序列,利用RACE克隆技术,克隆得油桐烯脂酰CoA还原酶的全长c DNA序列,命名为VfECR,并对该基因的核苷酸序列及其相应氨基酸序列的理化性质、疏水性/亲水性、跨膜结构域、蛋白质的二、三级结构、亲缘关系进行分析。结果表明:该基因全长1 154 bp,含有一个933 bp的开放阅读框,编码310个氨基酸,属于不稳定的亲水性蛋白,含有6个明显的跨膜结构域,且与陆地棉ECR蛋白的同源性最高,亲缘关系最为接近。同时利用RT-qPCR对VfECR基因的组织特异性和种子发育过程中...
【关键词】生物信息学 油桐 超长链脂肪酸 烯脂酰CoA还原酶 克隆技术 表达模式
【基金】国家林业公益性行业科研专项重点项目(201204403)
【所属期刊栏目】中南林业科技大学学报
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