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芒果CCR基因的克隆及其序列分析

2014-12-28分类号:S667.7

【作者】张宇  张波  赵志常  高爱平  陈业渊  黄建峰  党志国  罗睿雄  
【部门】海南大学应用科技学院  中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所  农业部华南作物基因资源与种质创制重点开发实验室  海南大学农学院  
【摘要】为了研究芒果CCR基因在芒果对芒果树抗性的功能。采用传统的RT-PCR和RACE方法从芒果的枝梢中克隆得到了1个参与木质素生物合成的肉桂酰辅酶-A还原酶基因(CCR)的全长c DNA序列,进而对得到的序列采用TMHMM、DNAMAN等软件进行生物信息学分析,发现芒果CCR基因包含编码区、3'和5'非翻译区的长度为1 292 bp的c DNA序列,编码305个氨基酸;对跨膜结构域进行了预测,发现该基因无跨膜结构域;蛋白二级结构元件以无规则卷曲和β-螺旋为主;聚类分析发现,该基因与美洲山杨木、油茶等植物的亲缘关系较近,而与百合、橡胶树等亲缘关系较远。从芒果中克隆得到了一个CCR基因,并对其生物信息...
【关键词】芒果  肉桂酰辅酶A还原酶  基因克隆  序列分析
【基金】农业部非营利性科研机构改革启动经费(CATAS,PZS-201225;CATAS-TCGRI,1630032013003;1630032014025)
【所属期刊栏目】华北农学报
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