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核桃基因组DNA甲基化修饰位点的MSAP分析

2014-12-15分类号:S664.1

【作者】周贝贝  文明  马庆国  裴东  
【部门】中国林业科学研究院林业研究所  林木遗传育种国家重点实验室  凉山州林业局  
【摘要】以‘中宁强’核桃品种成熟叶片为材料,采用优化的MSAP反应体系,在全基因组水平对核DNA进行甲基化修饰位点分析,结果表明:选用20对引物组合,共扩增出1 060条清晰、重复性好的谱带,平均每对引物扩增出53条谱带,其中,甲基化位点241个,甲基化修饰比例为22.73%。对部分核桃DNA甲基化修饰位点进行回收测序,得到10条存在DNA甲基化修饰的DNA序列,BLASTn分析表明,核桃基因组中多种类型的DNA序列存在甲基化修饰现象。
【关键词】核桃  MSAP  DNA甲基化  表观遗传学
【基金】国家自然科学基金项目(31171933)
【所属期刊栏目】林业科学研究
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