葡萄EST-SSR引物的开发及部分种质聚类分析
2014-04-28分类号:S663.1
【部门】河南农业大学园艺学院
【摘要】借助SSRs软件查找葡萄属含有SSR的EST序列,从葡萄属EST-SSR数据库中开发新型的EST-SSR标记,进行可利用性筛选,并设计引物。共开发出28对引物,从中筛选到16对多态性引物对62份葡萄材料进行PCR扩增。计算相似系数并构建聚类树状图,通过聚类分析研究葡萄属不同品种之间的亲缘关系,进一步验证EST-SSR在葡萄种质分类鉴定中的可行性。结果表明:绝大多数材料间的相似系数大于0.74,62份供试材料在相似系数0.658处可分为4个类群,大多数亲缘关系较近的种质资源都聚集在一起,相似系数种内较种间大,与传统分类情况基本一致。
【关键词】葡萄 EST-SSR 聚类分析
【基金】河南省教育厅科学技术研究重点项目(13A210484)
【所属期刊栏目】华北农学报
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