苹果MADS-box转录因子的生物信息学及其在不同组织中的表达
2014-03-16分类号:S661.1
【部门】中国农业科学院果树研究所
【摘要】【目的】分析已知苹果(Malus×domestica)MADS-box基因基本信息,研究其在不同组织中表达情况。【方法】利用NCBI数据库查询并获得苹果MADS-box基因,采用CLC Combined Workbench version 6、WebLogo 3、MEGA4.1、MapInspect和MEME等软件对其蛋白序列进行生物信息学分析。采用RT-PCR技术研究MdMADS基因在不同组织中的表达情况。【结果】共得到26个苹果MADS-box基因。MADS-box结构域分析显示,氨基酸10(I)、16-19(RQVT)、22-23(KR)、29-31(KKA)、33(E)、37-39(L...
【关键词】苹果 MADS-box 转录因子 生物信息学 表达分析
【基金】农业部公益性行业(201203034); 国家苹果产业技术体系(CARS-28); 国家自然科学基金(31201602)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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