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茶树CHS基因结构及编码区单核苷酸多态性分析

2014-01-24分类号:S571.1

【作者】张丽群  韦康  王丽鸳  成浩  刘本英  龚武云  
【部门】中国农业科学院茶叶研究所/国家茶树改良中心  云南省农业科学院茶叶研究所  
【摘要】【目的】通过试验获得茶树CHS基因(CsCHS)gDNA序列,以进一步确定CsCHS基因结构;研究CsCHS编码区单核苷酸多态性,并结合茶树多酚含量进行关联分析,寻找基因中可能存在的与茶多酚含量存在显著或极显著相关关系的SNP位点。【方法】根据NCBI数据库中已有CsCHS序列设计特异性引物,再分别以基因组DNA和cDNA为模板进行PCR扩增,经克隆、测序获得CsCHS1、CsCHS2、CsCHS3三个基因的gDNA和cDNA全长序列,通过序列比对方法确定CsCHS结构。利用Compute pI/Mw、SOPMA等软件对所得序列进行生物信息学分析,预测和比较CsCHS1、CsCHS2和CsCH...
【关键词】茶  查尔酮合酶基因(CHS)  单核苷酸多态性(SNP)
【基金】国家现代农业产业技术体系建设专项资金(nycytx-23); 浙江省自然科学基金(LY13C160004); 国家自然科学基金(31160175)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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