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杜仲MVA途径相关基因全长cDNA序列特征研究

2014-01-20分类号:S567.19

【作者】王淋  乌云塔娜  刘慧敏  叶生晶  杜红岩  
【部门】中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室  中南林业科技大学林学院  中国林业科学研究院经济林研发中心  
【摘要】杜仲幼果和成熟果转录组测序的基础上,分离鉴定了幼果和成熟果MVA途径ACOT、HMGS、HMGR基因全长cDNA序列,并对基因的核苷酸序列及其相应氨基酸序列的组成成分、跨膜结构域、疏水性/亲水性、蛋白质二、三级结构、分子系统进化等进行分析。EuACOT基因全长cDNA为1 248 bp,编码416个氨基酸,属于稳定疏水性蛋白,无明显的跨膜区,在进化上分属于不同的分类群,与烟草和番茄的ACOT蛋白间的亲缘关系最为接近;EuHMGS基因全长cDNA为1 356 bp,编码452个氨基酸,属于不稳定的疏水性蛋白,无明显的跨膜区,在进化上分属于不同的分类群,与茶树的HMGS蛋白间的亲缘关系最为接近;E...
【关键词】杜仲  萜类物质  MVA途径  序列分析  生物信息学
【基金】国家林业公益性行业科研专项(201004029); 国家“十二五”科技支撑计划项目(2012BAD21B0502)
【所属期刊栏目】中南林业科技大学学报
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