黄萎病菌侵染下陆地棉Dirigent-like蛋白基因表达差异分析
2014-11-25分类号：S435.621.2
【部门】中国农业大学农学与生物技术学院植物遗传育种系/杂种优势研究与利用教育部重点实验室/作物遗传改良北京市重点实验室 河北省农林科学院棉花研究所/农业部黄淮海半干旱区棉花生物学与遗传育种重点实验室
【摘要】目的发掘陆地棉Dirigent-like蛋白基因家族,明确不同黄萎病抗性品种间该基因家族成员的多态性及表达差异。方法利用Illumina Hiseq 2000测序平台,通过RNA-Seq测序技术,获得黄萎病菌侵染陆地棉抗病品种和感病品种的Dirigent-like蛋白基因家族成员Unigene序列;采用生物信息学软件对其进行核苷酸序列及编码蛋白的多重比对和系统进化分析;针对该家族成员设计特异的quantitative real-time PCR引物,在Applied Biosystems 7500 Real Time PCR System上使用SYBR green PCR试剂盒标记反应产物,棉...
【关键词】棉花 Dirigent-like蛋白基因 黄萎病菌 表达差异
【基金】国家重大专项“转基因优质纤维棉花新品种培育”(2011ZX08005-003)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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