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大丽轮枝菌分泌蛋白提取方法比较

2014-07-02分类号:S432.4

【作者】肖红利  桂月晶  祁伟彦  陈捷胤  李蕾  徐明  戴小枫  
【部门】中国农业科学院农产品加工研究所  
【摘要】【目的】采用超滤法(UF)、三氯乙酸沉淀法(TCA)、离子交换富集法(IEX)分别从大丽轮枝菌(Verticillium dahliae)高致病性菌株VdG1培养上清液中提取分泌蛋白,对提取样品进行质谱鉴定。寻找适合大丽轮枝菌分泌蛋白的提取方法,为大丽轮枝菌分泌蛋白组深入研究奠定基础。挖掘大丽轮枝菌分泌蛋白中潜在的致病相关蛋白,为其深入功能验证及致病机理研究提供平台。【方法】3种方法提取大丽轮枝菌VdG1分泌蛋白,shot-gun方法进行质谱鉴定。利用生物信息学软件WoLFPSORT、SignalP、TMHMM、PHOBIUS对其中经典分泌蛋白进行预测。通过CAZy和PHI数据库进行经典分泌蛋...
【关键词】大丽轮枝菌  分泌蛋白  提取方法  LC-MS/MS  比较
【基金】国家“973”计划(2013CB127803); 国家自然科学基金(31201472)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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